Biển Khánh Hòa chạy từ vịnh Vũng Rô đến TP.Cam Ranh, dài chừng 385km. Khánh Hòa có 4 vịnh là Vân Phong, Nha Phu, Cù Huân (nay gọi Nha Trang) và vịnh Cam Ranh. 4 vịnh này có vũng và cửa biển, đều là địa điểm du lịch nổi tiếng.

Vịnh nổi tiếng đầu tiên hướng từ Bắc vào Nam ở Khánh Hòa chính là Vân Phong vô cùng rộng lớn nhưng rất kín đáo. Bán đảo Bàn Sơn dài gần 30 cây số, chạy từ đèo Cổ Mã xiên theo hướng Đông Nam làm cánh cửa che gió Bấc. 

Vịnh Vân Phong có 2 cửa biển là cửa Vạn và cửa Giã. Cửa Vạn người Pháp gọi là Port Dayot ở tại đầm Môn, dưới chân đảo Bàn Sơn. Cửa Giã nằm tại Vạn Giã, nước sông Hậu xả ra cửa này. Sau này, cái tên Vạn Ninh là do tên hai cửa biển này ghép lại.

Bán đảo Phước Hà dài trên 20 cây số, cũng chạy xiên xiên theo hướng Đông Nam, làm cánh cửa che gió Nam. Trong vịnh có vũng Trầu Nằm ở Tu Bông, vũng Hòn Khói ở Ninh Hòa, đối diện và ở gần cuối dãy Phước Hà có vũng Cây Bàn. Các vũng này đều là nơi sinh sống của người dân địa phương với ngành nghề chính vẫn là đánh bắt, nuôi trồng thủy sản.

Hiện nay, tỉnh Khánh Hòa đã trình Thủ tướng Chính phủ phê duyệt điều chỉnh quy hoạch chung xây dựng Khu kinh tế Vân Phong, có tăng thêm đất ở, casino, bến thủy phi cơ, sân bay dân dụng...

Thứ hai trong danh sách các vịnh ở Khánh Hòa là Nha Phu. Bề ngang Vịnh Nha Phu gần 6 cây số, bề dài chừng vài chục cây số; gần bằng một góc tư vịnh Vân Phong.

Trong vịnh Nha Phu có cửa Hà Liên và cửa sông Dinh ở Ninh Hòa chảy xuống. Trong lịch sử, thuyền ghe lên xuống cửa Hà Liên để buôn bán cùng Ninh Hòa.

Thứ ba là vịnh Cù Huân (sau này là vịnh Nha Trang) - vịnh quan trọng bậc nhất của tỉnh Khánh Hòa. Vịnh Nha Trang trống trải, gió Nam gió Bấc thổi qua đều không có sức ngăn cản cho nên không được thuận lợi cho tàu thuyền trong những lúc gió to sóng dữ.

Vịnh Nha Trang có hai cửa biển là Cửa Lớn tức cửa Nha Trang và cửa Bé tức cửa Trường Đông. Cửa Lớn tên chữ là Đại Cù Huân, cửa Bé tên gọi là tiểu Cù Huân. Trong lịch sử, cửa Lớn tức cửa Nha Trang là một hải cảng quan trọng ở Trung Việt, tàu buôn, tàu chiến đều thả neo. Riêng cửa Bé thuận lợi cho việc chài lưới và đặc biệt nước mắm ngon ở nơi này, phần lớn do cửa Bé mà ra.

Đặc biệt, trong vịnh Nha Trang hiện nay có Khu bảo tồn biển Hòn Mun là một khu bảo tồn sinh vật biển qua trọng. Khu bảo tồn biển này gồm các đảo nằm trong vịnh Nha Trang như: Hòn Tre, Hòn Miễu, Hòn Tằm, Hòn Một, Hòn Mun, Hòn Cau, Hòn Vung, Hòn Rơm và Hòn Ngọc.

Cuối cùng trong danh sách các vịnh ở Khánh Hòa không thể không nhắc đến Cam Ranh, vịnh có ý nghĩa chiến lược về an ninh, quốc phòng.

Cam Ranh là vịnh rộng rãi và kín đáo, là một hải cảng đứng vào hàng hải cảng tốt nhất Á Đông, về mặt quân sự cũng như thương mại.